校史 

本學院創立於民國前10年，是我國軍事院校中歷史最悠久之學府，本學院之前身為軍醫學校，民國36年6月1日與戰時衛生人員訓練所及其分校、分所等13個單位，合併組成國防醫學院於上海江灣，為醫學中心制。民國38年隨政府遷台至台北水源地；民國72年7月1日，將三軍總醫院正式歸併為本學院之直屬教學醫院，使本學院教育組織型態更趨密切。後為因應國防醫學發展及配合時代之需要，培育高級師資及研究人才，並充實基層幹部，先後增設博、碩士班研究所及衛勤專科等教育班次。民國88年底，於「國防醫學中心整建工程」完工後，搬遷至內湖現址。

教育體系

一、基礎教育：

（一）大學部：現有醫學系、牙醫學系、藥學系、護理學系及公共衛生學系等5學系。

（二）基礎學科：計有通識教育中心、生物及解剖學科、生理及生物物理學科、生物化學科、藥理學科、微生物及免疫學科、生物醫學工程學科等；另醫學系下轄內科學科、外科學科、婦產學科、小兒學科、急診醫學科、皮膚學科、耳鼻喉學科、放射診斷學科、放射腫瘤學科、家庭醫學科、核子醫學科、病理學科、神經學科、骨科學科、眼科學科、麻醉學科、復健醫學科、精神學科等。

二、深造教育（研究所）： 

（一）博士班：計有醫學科學研究所及生命科學研究所（與中央研究院及國家衛生研究院合辦）。

（二）碩士班：計有牙醫科學研究所、藥學研究所、護理學研究所、公共衛生學研究所、生物及解剖學研究所、生理及生物物理學研究所、生物化學研究所、藥理學研究所、微生物及免疫學研究所、病理及寄生蟲學研究所、航太及海底醫學研究所等。

教育時程及內容 

一、基礎教育（大學部）： 

（一）醫學系：修業年限6年、修習221學分，畢業後授予醫學士學位，軍費生以中尉任官。

（二）牙醫學系：修業年限6年、修習243學分，畢業後授予牙醫學士學位，軍費生以中尉任官。

（三）藥學系：修業年限6年、修習215學分，畢業後授予臨床藥學士學位，軍費生以中尉任官。

（四）護理學系：修業年限4年、修習136學分，畢業後授予護理學士學位，軍費生以少尉任官。

（五）公共衛生學系：修業年限4年、修習134學分，畢業後授予公共衛生學士學位，軍費生以少尉任官。

二、深造教育（研究所）： 

（一）教育時間：博士班修業年限2至7年。碩士班修業年限1至4年。

（二）教育內容：以培養專門科學技術人才，蔚為國用。醫學士逕攻讀博士學位應修習30學分，論文12學分，碩士攻讀博士學位應修習18學分，論文12學分；碩士班至少須修習30學分（含論文6學分）。  

學生概況及師資 （人數統計至112年2月底）

一、學生概況

（一）入學方式：大學部透過國防部「軍事學校正期班」甄選入學考試後擇優錄取，另有衛生福利部「原住民族及離島地區醫事人員養成計畫」公費生及「海外聯合招生委員會」僑生等入學管道。

（二）學生人數：大學部學生約1,471人、碩士班研究生約463人，博士班研究生約267人。

（三）依大學法之規定，本學院之學則與各公立大學修業規則相同，採「學年學分制」，以利學生增加選修個人有興趣之課程。 

二、師資：

（一）本學院師資素質優良，專任教師現約374人，其中具博士學位者約242人、具碩士學位者約21人、具學士學位者約111人。

（二）專任教師經教育部審定具教師資格者：教授約89人、副教授約97人、助理教授約105人、講師約59人，另每年延聘國內外著名專家學者蒞校講課。  

教學醫院及其他實習機構 

一、教學醫院：

三軍總醫院為本學院之直屬教學醫院，各項醫療設施完善，現有床位約1,810床，醫療服務之對象包含現役軍人、軍眷、警消及一般民眾等，除負責國軍衛生勤務及各項醫療作業外，並負有臨床教學及研究發展等任務，為衛生福利部評定之醫學中心。

二、其他實習機構：

除三軍總醫院外，臺北、臺中及高雄榮民總醫院、奇美醫院、馬偕紀念醫院、台大醫院、林口長庚醫院、榮民、景德、永信及杏輝等製藥廠、三軍衛材供應處、各縣市衛生所及健康服務中心、衛生局、環境保護局等，均為本學院學生之實習場所。